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云南中医药大学重点学科为中医学、药店、中西医结合、药店、中西医结合基础、民族医学、针刺、中医内科、中医基础理论、临床中药学、实用中药、中医脑病学、益药房、中医儿科、按摩、中医老年病学等，以下为具体名单，以供参考，可调整的，以学校最新公告为准。
1、云南中医药大学重点学科名单
云南省重点学科名单
| 序号 | 类别 | 学科名称 |
| 1 | 云南省“一流学科”A类高原学科 | 中医学 |
| 2 | 中药学 | |
| 3 | 中西医结合 | |
| 4 | 云南省“十二五”立项建设博士学位授权一级学科 | 中医学 |
| 5 | 中药学 | |
| 6 | 云南省“十二五”优势特色学科 | 中西医结合 |
| 7 | 药学 | |
| 8 | 云南省“十一五”重点学科 | 中西医结合基础 |
| 9 | 民族医学 | |
| 10 | 云南省“十五”重点学科 | 针灸学 |
| 11 | 云南省“九五”重点学科 | 中医内科学 |
| 12 | 中医基础理论 | |
| 13 | 临床中药学 | |
| 14 | 云南省“八五”重点学科 | 实用中药学 |
| 15 | 2018年省级中医药临床重点学科 | 中医脑病学 |
国家中医药管理局重点学科一览表
| 序号 | 类 别 | 学科名称 |
| 1 | 国家中医药管理局“十二五”重点学科 | 彝药学 |
| 2 | 中医儿科学 | |
| 3 | 推拿学 | |
| 4 | 中医老年病学 | |
| 5 | 中医耳鼻喉科学 | |
| 6 | 傣药学 | |
| 7 | 国家中医药管理局“十二五”培育学科 | 中医心理学 |
| 8 | 中医管理学―中医药对外合作管理学 | |
| 9 | 中医文化学 | |
| 10 | 中西医结合基础 | |
| 11 | 中医人类学 | |
| 12 | 中医预防医学 | |
| 13 | 国家中医药管理局“十一五”重点学科 | 中医男科学 |
| 14 | 中医痹病学 | |
| 15 | 中医肾病学 | |
| 16 | 临床中药学 | |
| 17 | 傣医学 |
2、云南中医药大学简介
云南中医药大学，简称云中，位于云南省昆明市，是云南省人民政府与国家中医药管理局共建的大学，全国第二批设立的高等中医药本科院校，是云南省唯一一所中医药本科院校。
云南中医药大学的前身是创建于1960年的云南中医学院，1986年获得硕士学位授予权，2016年成为云南省人民政府与国家中医药管理局共建大学，2018年更名为云南中医药大学。